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Les rongeurs se nourrissent de racines, de bulbes, de tubercules et de graines mais les dommages qu'ils occasionnent sont surtout liés au fait qu'ils creusent des galeries dans le sol, en coupant tout ce qu'ils trouvent sur leur chemin. Cela peut expliquer la mort brutale de plantes qui étaient la veille encore en pleine santé et robustes, ou bien l'échec total de certains semis, provoqué par le bouleversement du sol. Les rongeurs marquent, par leur déjections, le chemin qui mène à leur nid et à tout leur territoire ; une communauté de ces animaux peut régner sur une surface d'une centaine à un millier de mètres carrés. Ils fabriquent des nids d'au moins 30 cm de profondeur, pourvus de plusieurs trous de sortie et de galeries qui mènent à des entrepôts où ils amassent des provisions : racines, tubercules, bulbes ainsi que des graines à l'exception du campagnol qui n'est pas granivore.

Les appâts empoisonnés n'ont pas beaucoup de succès avec les rongeurs que l'on peut capturer éventuellement avec des pièges placés à la sortie des galeries. On peut également procéder de cette manière pour les taupes, strictement insectivores et que, normalement, on devrait protéger, mais qui coupent toutes les racines qu'elles rencontrent lorsqu'elles créent leurs galeries.

Pour s'assurer de la présence de ces animaux dans les galeries et vérifier que les monticules de terre dans le potager ne sont pas le signe d'un territoire abandonné, il faut fermer le soir les ouvertures en faisant s'ébouler la terre à l'intérieur. Si les tanières sont habitées, le matin les voies d'accès auront été restaurées. De nos jours, on utilise beaucoup de petits appareils à ultrasons pour lutter contre ces animaux.